可能是你生成自动生成目录时出错了，查重系统识别不出来。

首先，要设置好标题，在“开始”栏中设置好一级标题、二级标题、三级标题，也就是样式中的标题1、2、3。

然后，连续点击第一页的底部，选择设置页面格式，设置好页码。

再然后，按Ctrl+Enter，新建空白页，光标停留在空白页。

最后，点击引用，选择目录及目录样式，就自动生成目录啦~

最最后，只需要根据实际需要，对目录格式进行调整就可以了

也许这样口述不清楚，建议去zaojiance论文查重系统上查一查“目录被标红”的相关内容，我也是从那上面看到的。

参考文献标红应该是参考文献格式不正确，系统没有识别出是参考文献，注意以下几点1参考文献这四个字设置为标题格式 2全选，数字和字母采用罗马体，标点符号修改为半角格式 3格式必须国标格式百度上有。

问：论文查重为什么附录也被标红了？

说明附录部分相似度也特别高，建议你重新调整语序，或者换成相近的意思表达一下，然后重复率就可以降低不少，希望采纳，谢谢。