肯定要查的，全文检查，从摘要到致谢，所以只能把其它地方的重复率控制到最低

因为实验方法这一块，是肯定要重复的

建议你先去文天下论文检测网用知网测一测，然后有针对性的降低重复率。

博士论文肯定是要查重的，但是他的参考文献是不需要查询的，因为参考文献不可能是自己编出来的，不可能是自己写的。

可以，不过最好要找要一下导师，和导师说明下情况，因为你改好 以后别的导师还要再看一遍，给那个导师增加工作量，这是让人很生 气的地方，所以一般导师都会很讨厌，你最好找导师帮忙，他和其他老师熟一些，说到底，你是让人家帮忙的，得让人家愿意才好。把关系处理好。

另外，论文 不要改动太大，尤其是文章的大结构。如果变化太大，导师会气死，大家都很忙，没人愿意多劳动。那你自己很危险。