本科论文引用在知网找不到的硕士论文，对查重检测肯定是有影响的。

知网查重并不是只检测是否和本网站论文有重复，互联网、历届论文、书籍都会查。不过也不用太过担心，引用部分只要格式正确，没有超出引用的比例，在查重时这部分内容是不算到重复率中的。

机器人降重非人工修改，不能保证降低后的重复率达到理想效果，可能存在个别语句不通顺的情况，降重后自己要仔细查看修改通顺，所以不太建议软件降重，不过你可以去试试北京译顶科技，那边都是人工降重

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不会的。查重的时候 引用部分不是你标出引用就算为引用的，而是看你那一句话是否都是照搬的某篇文章，全部照搬则为引用（标为绿色），稍有改动则是复制（标为红色）