不明白，什么论文一定一万多字啊？本科毕业论文？这个一般不查重复的，往往允许有比较高的相似度，所以只要你不是全抄的就没问题。

而且你“把自己的内容复制粘贴了一遍”是什么意思？把前面的内容复制到了后面，这样软件肯定查不出，但老师要是负责的话能看出来。如果是把自己发表的论文复制了一下到新文章里，可以先说明一下，这是允许的。

知网对pdf格式的论文识别不是太好，附录目前知网默认都是查重的。你可以问问学校要不要查重附录。

还是要再测测，每个软件的数据库不太一样。算法也有区别，当然结果也有区别。相差的这个数值是确定不了的，每个人的文章不一样，差值就不一样。

所以，如果学校用的是知网，你最后还是要用知网确定下的。

每个软件的数据库不太一样。而且算法也有区别，结果是有区别的，并且笔杆论文查重的数据库也很强大，结果严格，所以存在这种情况不奇怪。

最后还是要看学校用什么，就以什么为准。

每个查重的系统的算法和数据库都是有差别的，而对于一个查重系统来说，算法和数据库是核心，查重结果跟这两个因素有很强的关系。